Предимства на електронния микроскоп
По-голямо увеличение
Размерът на обект, който учен може да види чрез оптичен микроскоп, е ограничен до най-малката дължина на вълната на видимата светлина, която е приблизително 0, 4 микрометра. Всеки обект с диаметър, по-малък от този, няма да отразява светлината и следователно няма да бъде видим в инструмент, базиран на него. Някои примери за такива малки обекти са атоми, молекули и вирусни частици. Електронните микроскопи могат да генерират изображения на тези обекти, тъй като те не зависят от светлината на видимия спектър, за да ги отразяват, но високоенергийни електрони се прилагат върху изследваната проба; поведението на тези електрони (как се отразяват и отклоняват от обекта) се открива и използва за генериране на изображение.
Подобрена дълбочина на полето
Способността на оптичния микроскоп да образува триизмерни изображения на изключително малки обекти е ограничена. Това е така, защото можете само да фокусирате едно ниво на пространство в даден момент. Разглеждането на сравнително голям микроорганизъм с този микроскоп демонстрира ефекта: слоят от организми ще бъде на фокус, но другите слоеве ще бъдат замъглени и фокусирани и дори могат да се намесват в част от фокусираното изображение. Електронните микроскопи предлагат по-голяма дълбочина на полето, което означава, че няколко слоя от две размери в даден обект могат да бъдат фокусирани едновременно, осигурявайки общ образ на триизмерното качество.
По-фино регулиране на увеличението
Типичният оптичен микроскоп може да се използва само на дискретни нива. Например, обикновените микроскопи в средните училища могат да увеличават обектите на нива 10x, 100x и 400x, без междинни стойности. Не трябва да се изненадва, че може да има микроскопични обекти, които да се визуализират по-добре с увеличения от 50x или 300x, което би било недостижимо с тези микроскопи. Електронните микроскопи, от друга страна, предлагат удобна гама от увеличения. Те могат да постигнат това поради естеството на своите "лещи", които са електромагнити, чиито устройства за захранване могат да се коригират, за да променят леко траекторите на електроните, насочени към детектора, за да образуват изображение.